Case départ

Contenu

Case départ#

Cette page décrit comment accéder au matériel pédagogique (cours, TP) avec les logiciels requis pour travailler dessus interactivement.

Généralités#

Chaque semaine, vous téléchargerez un devoir, c’est-à-dire un répertoire contenant le matériel pédagogique: sujet de TD, de TP, éventuellement documents de cours. En semaine 1, ce sera le devoir Semaine1 qui ira dans le répertoire ~/IntroScienceDonnees/Semaine1. Il y aura aussi un devoir pour le projet.

Vous déposerez ensuite régulièrement votre devoir. Cela aura pour effet de sauvegarder votre travail sur la forge logicielle GitLab de l’université. Cela vous permettra de le transférer ensuite facilement entre les différents endroits où vous travaillerez dessus (sur MyDocker ou en local). Le dépôt vous permettra également d’obtenir un retour automatique sur votre travail.

Cela permettra aussi à vos enseignants de se faire une idée de l’avancement général du groupe car ils peuvent ainsi récupérer vos devoirs. Cela pourra servir pour des TP notés (vous serez prévenu à l’avance par votre enseignant de TP).

Le matériel pédagogique est disponible pour tous, inscrits officiellement au cours ou auditeurs libres. En revanche, le dépôt sur la forge GitLab de l’Université Paris-Saclay n’est possible que pour les étudiants et personnels de l’université.

Travo, innovation et expérimentation pédagogique

Cette gestion des devoirs via GitLab est une innovation menée depuis la rentrée 2020 en collaboration avec des collègues de l’université et de Montréal et inspirée notamment des «GitHub ClassRoom» avec le développement d’un outil, Travo, sur lequel est basé la commande info-111. Elle apporte de nombreux avantages: validation automatique sur votre travail, premiers contact avec les outils collaboratifs, etc.

Travo est en développement agile constant. Chaque nouveauté est motivée par un besoin pour mieux vous servir, et vous êtes les premiers à en bénéficier. En retour, nos TPs sont autant d’occasions pour nous pour observer et évaluer l”expérience utilisateur.

Plus généralement, nous explorons sans cesse dans ce cours les frontières de ce que les outils actuels peuvent offrir (ou pas!) pour l’enseignement. À l’occasion des nouveautés peuvent sortir un peu brûlantes du four et présenter des imperfections; signalez-les nous et nous les corrigerons dans la foulée ou ferons remonter le signalement aux développeurs des outils!

Instructions#

Étape 0 : pour les redoublants#

Attention

La première fois que vous travaillerez sur ce cours sur les ordinateurs des salles de TP et la première fois que vous travaillerez sur le service JupyterHub, vous devrez déplacer vos devoirs de l’an dernier afin qu’ils ne se mélangent pas avec ceux de cette année.

Dans les instructions ci-dessous, avant d’ouvrir le tableau de bord, ouvrez un terminal, et tapez les commandes suivantes :

mkdir -p 2022-2023
mv IntroScienceDonnees 2022-2023

En cas de doute, demandez à votre enseignant.

Étape 1 : Accéder à l’environnement de travail#

Pour travailler sur les devoirs, vous avez plusieurs options, listées ci-dessous par ordre décroissant de préférence.

Avec le service MyDocker (recommandé)

Ouvrez le tableau de bord du cours.

Vous devrez cliquer sur «Connexion avec le CAS», vous authentifier avec vos identifiants Adonis, confirmer le consentement de partage de quelques attributs à myDocker, puis cliquer sur «Demander un environnement» et «Connexion à l’interface».

Étape 2 : Téléchargement et ouverture des feuilles d’exercices#

À ce stade, vous devriez être sur une feuille nommée « Tableau de bord du cours ». Suivez les instructions pour faire apparaître le tableau de bord qui sera similaire à celui-ci :
En utilisant le tableau de bord, téléchargez puis ouvrez le devoir de la semaine (par exemple Semaine1).
Suivez les instructions qu’il contient.

Étape 3 : Dépôt des feuilles d’exercices#

Accédez au tableau de bord du cours comme ci-dessus, et déposez votre travail.

Correction automatique et manuelle#

Chaque fois que vous déposez un devoir, les carnets Jupyter sont re-exécutés, avec vérification des tests qu’ils contiennent (CHECK(...) en C++; ASSERT(...) en Python). Cette correction automatique se fait par intégration continue sur la forge GitLab au moment du dépôt, à l’aide de l’outil nbgrader; elle prend quelques minutes et donne lieu à un score.

Certains TPs seront notés en partie manuellement : le dernier score obtenu avant la date limite de rendu donnera une note. Cette note pourra être complétée par une correction manuelle: vos enseignants regarderont vos réponses et vos interprétations des résultats, et attribueront des points à chacune d’entre elles. Cette correction prendra quelques jours.

Les résultats de la correction automatique et manuelle seront disponibles sur GitLab. Pour les consulter:

Ouvrez le tableau de bord.
Le score s’affiche s’il est disponible.
Cliquez sur le score pour consulter les détails sur GitLab.

Bonnes pratiques#

Vos répertoires personnels en salle de TP et sur les services JupyterHub@Paris-Saclay ou MyDocker sont distincts. Si vous travaillez sur un devoir (par exemple Semaine1) de part et d’autre, il y a risque de conflit entre les deux versions.

Bonnes pratiques :

lorsque vous commencez à travailler, téléchargez systématiquement votre devoir pour vous assurez que vous travaillez bien sur la dernière version.
déposez régulièrement votre travail, et en particulier systématiquement lorsque vous avez fini de travailler.

En cas de divergence ou de conflit#

Le dépôt de votre travail sur GitLab peut échouer en indiquant qu’il y a des modifications sur votre dépôt GitLab que vous n’avez pas en local.

Voici deux scénarios types où cela peut se produire :

Vous travaillez sur Semaine1 sur MyDocker et vous déposez votre travail à la fin. Plus tard, vous allez en salle de TP et vous travaillez sur Semaine1, mais sans y avoir au préalable retéléchargé votre devoir. Vous avez alors deux versions de votre travail qui ont divergé. Les bonnes pratiques ont pour objectif d’éviter cela.
Vous téléchargez votre sujet et travaillez dessus, mais votre premier dépôt n’intervient que quelque temps plus tard. Entre temps, le sujet a été mis à jour et la mise à jour s’est propagée à votre dépôt personnel.

Lancez alors un téléchargement. Il y a des chances que cela se passe bien : les modifications sont automatiquement fusionnées. Dans le cas contraire, il vous sera proposé de forcer la mise à jour avec une commande dans le terminal comme :

cd ~/IntroScienceDonnees
./course.py fetch Semaine1 --force

Votre dossier Semaine1 sera alors renommé avec la date et l’heure Semaine1-2024-..., et la version déposée sur GitLab sera téléchargée dans Semaine1. Vous devez alors résoudre le conflit : consultez les documents dans les deux dossiers et faites le nécessaire pour que la version que vous souhaitez soit dans Semaine1; vous pouvez par exemple utiliser le navigateur de fichiers de Jupyter pour déplacer les fichiers sur lesquels vous avez récemment travaillé depuis Semaine1-2024-... dans Semaine1. Il vous reste à déposer à nouveau.

Instructions avancées#

Cette section décrit comment utiliser le terminal pour gérer vos devoirs (téléchargement, dépôt, …) plutôt que d’utiliser le tableau de bord. Vous découvrirez au fur et à mesure de l’année tous les avantages d’utiliser le terminal.

Ouvrir un terminal#

Option 1 : Sur les ordinateurs des salles de TP

Vous pouvez utiliser le menu principal du système (bouton tout en bas à gauche de l’écran) et cliquer sur « Terminal ».

Option 2 : depuis JupyterLab (par exemple avec le service MyDocker ou JupyterHub)

Utilisez le menu Fichier -> Nouveau -> Terminal.

Télécharger ou mettre à jour un devoir avec le terminal#

Après avoir ouvert un terminal, tapez les commandes suivantes, en validant avec Entrée après chacune d’entre elles. Attention : ces commandes doivent être tapées avec le plus grand soin : les majuscules, les espaces, les symboles sont tous importants.

Si vous n’avez pas encore de répertoire IntroScienceDonnees :

cd
git clone https://gitlab.dsi.universite-paris-saclay.fr/L1InfoInitiationScienceDonnees/ComputerLab.git IntroScienceDonnees

Téléchargez le devoir :
```
cd ~/IntroScienceDonnees
./course.py fetch Semaine1
```
Si une authentification vous est demandée, utilisez vos identifiants Adonis prenom.nom, comme sur GitLab. Il est normal que rien ne s’affiche quand vous tapez votre mot de passe. Tapez-le simplement en entier puis appuyez sur Entrée.

Si vous n’avez pas de compte sur https://gitlab.dsi.universite-paris-saclay.fr/ (par ex. auditeurs libres), vous pouvez alternativement utiliser :
```
./course.py fetch --anonymous Semaine1
```
Votre terminal devrait ressembler à ceci :
Le devoir a été téléchargé dans le répertoire IntroScienceDonnees/Semaine1 de votre répertoire personnel. Vous pouvez le vérifier avec la commande suivante :
```
ls ~/IntroScienceDonnees/Semaine1
```
Vous pouvez maintenant naviguer – par exemple avec le navigateur de fichiers de Jupyter – jusqu’au répertoire IntroScienceDonnees/Semaine1 et ouvrir le fichier index.md pour commencer à travailler.

Valider une feuille Jupyter avec le terminal#

Consultez la documentation du script “./course.py” :

    cd ~/IntroScienceDonnees
    ./course.py

Suivez les instructions.

Déposer votre travail avec le terminal#

Dans un nouveau terminal, tapez les instructions suivantes pour aller dans le répertoire IntroScienceDonnees et déposer votre travail. Remplacez Semaine1 ci-dessous par le nom du devoir et MI1 par votre groupe de TD :
```
cd ~/IntroScienceDonnees
./course.py submit Semaine1 MI1
```
Une fois votre travail déposé, vous pouvez ouvrir l’adresse affichée (clic droit, Ouvrir le lien) pour consulter ce que vous avez déposé sur GitLab. Votre travail est maintenant sauvegardé et vous pouvez y accéder depuis chez vous.

Lancer JupyterLab#

Attention

Si vous travaillez sur MyDocker ou bien JupyterHub, il n’est pas nécessaire de lancer JupyterLab! Il est déjà lancé.

Ouvrez un nouveau terminal.

Tapez la commande suivante :

cd ~/IntroScienceDonnees
./course.py jupyter lab

Cette application ouvre une fenêtre dans votre navigateur web avec un navigateur de fichiers.

Attention

Le terminal qui vous a permis de lancer Jupyter doit rester ouvert pendant toute votre utilisation de Jupyter! Le mieux est de le minimiser (sans le fermer!). De plus tant que Jupyter est lancé, il n’est pas possible de taper d’autres commandes dans ce terminal. Si vous avez à nouveau besoin d’un terminal par la suite, il faudra utiliser un autre terminal.

Commandes de base dans le terminal#

Lister les fichiers :

ls

Se déplacer dans un répertoire xyz :

cd xyz

Créer un répertoire xyz :

mkdir xyz

Astuces

Les touches flèche vers le haut et flèche vers le bas permettent de naviguer dans l’historique des commandes précédemment lancées.
Complétion automatique : pour aller plus vite, au lieu de taper le nom d’un fichier ou répertoire en entier, vous pouvez indiquer le début du nom et essayer de le compléter avec la touche TAB (tabulation, à gauche de la touche A). Si plusieurs façons de compléter votre saisie sont possibles ,elles vous seront proposées (peut-être en tapant une deuxième fois TAB. Ici, pour ProgImperative, tapez Pro puis la touche TAB.